Sudah menjadi agenda rutin bahwa setiap Jumat pertama tiap bulan para murid diwajibkan mengikuti pendalaman iman bersama para frater dari SCJ. Pendalaman iman ini bertujuan mendasari para murid akan iman kristiani sebagai pondasi utama dalam keseharian. Meskipun sudah ada pelajaran pendidikan agama namun pendalaman iman ini juga diperlukan agar para siswa semakin tangguh imannya dalam menghadapi kemajuan dan tantangan jaman. 

     

    

Pendalman iman ini rutin dilaksanakan di aula Yayasan Karya Sang Timur Korwil DIY - Jateng dan wajib diikuti seluruh murid dari kelas X hingga kelas XII. Selain itu para guru juga diharapkan turut serta mendampingi murid dalam kegiatan pendalaman iman ini.